工程合同纠纷处理方法有和解、工程调解、合同仲裁和诉讼。纠纷出现建筑工程合同纠纷向法院起诉的样处，诉讼时效是理好三年，从当事人知道权利被侵犯时开始计算。工程合同纠纷发生后，合同当事人如果没有仲裁协议，纠纷任何一方均可以向人民法院提起民事诉讼。样处
一、理好工程合同纠纷怎样处理好
1.和解。工程和解是合同指当事人因合同发生纠纷时可以再行协商，在尊重双方利益的纠纷基础上，就争议的样处事项达成一致，从而解决纠纷的理好方式。和解是当事人自由选择的在自愿原则下解决台同纠纷的方式，而不是合同纠纷解决的必经程序。当事人也可以不经协商和解而直接选择其他解决纠纷的途径。
2.调解。凋解是指在第三人的主持下，通过运用说服教育等方法来解决当事人之间的合同纠纷。调解有两种方式，一是人民调解委员会调解当事人发生合同纠纷，可以向纠纷当事人所在地或者纠纷发生地的人民调解委员会申请调解。二是行政调解。主要特指工商行政管理机关居中对合同当事人的纠纷进行调解。
3.仲裁。仲裁是指发生合同争议的双方当事人，根据争议发生前或发生后达成的仲裁协议，将纠纷提交仲裁机关进行裁决并解决纠纷的方式。仲裁具有“准司法”性质，仲裁机构作出的仲裁裁决具有法律效力，当事人应当履行。
4.诉讼。诉讼是指合同纠纷发生后，当事人如果没有仲裁协议，任何一方均可以向人民法院提起民事诉讼，请求人民法院对合同纠纷依法予以处理。这是解决合同纠纷的最常见方式。合同纠纷经人民法院审理并作出判决后，当事人对人民法院作出的发生法律效力的判决书，调解书必须履行，拒不履行的，另一方当事人可以申请人民法院强制执行。
二、民法典建筑工程合同纠纷诉讼时效
律师在线提醒您，民法典规定，出现建筑工程合同纠纷向法院起诉的，诉讼时效是三年，从当事人知道权利被侵犯时开始计算。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条 【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
三、工程合同有几种类型
承包关系类型合同
工程合同的履行期一般都是很长的，只有一个施工单位进行建设是无法按时竣工的，那么就出现了分包这种形式。
计价方式合同
1.固定总价合同。采用这类合同的工程，其总价是以施工图纸和工程说明书为计算依据，在招标时将造价一次包死。在合同执行过程中，不能因为工程量、设备、材料价格、工资等变动而调整合同总价。但人力不可抗拒的各种自然灾害、国家层面统一调整价格、设计有重大修改等情况除外。
2.计量合同。计量合同又称为单价合同，分为两种形式：
工程阶段合同
1.勘察合同。勘察设计合同，是委托方与承包方为完成一定的勘察设计任务,明确相互权利义务关系的协议。是进行工程建设的第一阶段。
2.设计合同。设计合同的内容包括设计施工方案等等方案，是工程建设额的第二阶段。
3.工程合同。工程合同是最重要的一个部分，合同中约定了工程款，竣工时间等等。是工程建设的第三阶段，也是最后一个阶段。
